کوه خضر نبی در ۶ کیلومتری مرکز قم به سمت جنوب و در جوار شهرک قدس قرار دارد. شهر قم را از فراز این کوه می‌توان دید. بر قله این کوه در سه هزار سال پیش غاری بوده که امروز به مسجد کوچکی تبدیل شده است و گفته می‌شود که محل زیارت خضر نبی بوده است. این کوه در گذشته محل نیایش عارفان بوده است. ارتفاع کوه حدود ۳۰۰ متر است و در نزدیکی کوه دو برادران در ادامه رشته‌کوه زاگرس قرار دارد. مسجد جمکران نیز در نزدیکی این کوه قرار دارد. مسیر زائران مسجد جمکران طوری طراحی شده که از دامنه این کوه می‌گذرد. کوه خضر نبی از نظر تفریحی نیز مورد توجه ساکنان قم بوده و همچنین در طراحی مسیر بالارفتن از این کوه این نکته در نظر گرفته شده است که هر گروه سنی چه خردسال و چه کهنسال بتواند از آن بالا برود.
