کلیسای فنایی مربوط به سده ۷ و ۸ ه.ق است و در خوی، حومه شهر واقع شده است. این اثر در تاریخ ۲۵ اسفند ۱۳۷۹ با شماره ثبت ۳۳۸۰ به عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسیده است. کلیسا در حومه شهرستان خوی در روستایی به همین نام و در میان خانه‌های روستایی قرار دارد. این بنا از قلوه‌سنگ و سنگ لاشه ساخته شده و قوس‌های جناغی آن از آجر و پوشش‌های گنبد آن سنگی است و محرابی به طرف شرق دارد. این نقوش که در اندود گچ به کار رفته است عمدتاً نقوش اسلیمی گل و بوته است. طرفین محراب نیز دارای مقرنس‌کاری زیبایی است. این کلیسا توسط هیأت ایتالیایی در ردیف آثار متعلق به قرن 18 میلادی معرفی شده است.
