بنای اولیه مسجد تاریخی شیخ بابا در مراغه مربوط به قرون هشتم و نهم هجری است که بر پایه‌های آن، مسجد کنونی بازسازی شده است. آنچه امروزه از مسجد جامع شیخ بابا باقی مانده، یک ستون سنگی و دو ستون چوبی مقرنس‌کاری شده می‌باشد، این ستون سنگی استوانه‌ای شکل و مرکب از 20 قطعه سنگ مدور است که روی هم گذاشته شده و در مجموع ارتفاع آن به 5 متر و محیط آن به 186 سانتی‌متر می‌رسد، 60 سانتی‌متر از پایین ستون صاف و بدون نوشته است. بخش بالایی این ستون کتیبه‌ای به خط ثلث در اندازه 160 سانتی‌متر وجود دارد، نام امام علی و پیامبر اسلام در ستون نوشته شده و تاریخی که در ستون نوشته شده 864 ه.ق است و متن کتیبه شامل نام‌های مشایخ و مریدهای شیخ بابا و نام بانی بنا و حجار آن می‌باشد و اخیراً این ستون سنگی برای حفاظت بیشتر به موزه مراغه منتقل شده است و این ستون سنگی مدور به شماره ثبتی 790 در فهرست آثار ملی به ثبت رسیده است.
