«موزه تاریخ طبیعی»، از دیگر جاذبه‌های گردشگری در شهرستان اردبیل است که به همت گردآورندگان و مسئولین شهر، میزبان بازدیدکنندگان متعددی از سراسر استان و کشور است. این موزه با در اختیار داشتن بیش از ۱۲۰ گونه مختلف حیوانی که متشکل از ۲۰ گونه از پستانداران، ۸۰ گونه از انواع پرندگان، ۱۲ گونه از دوزیستان شامل ماهیان و خزندگان و ۸ گونه حیوانات وحشی کمیاب است، مجموعه‌ای جالب و قابل توجه از تاریخ طبیعی کشور و استان اردبیل را برای علاقه‌مندان فراهم کرده است. همچنین در این موزه می‌توان بخش‌های مختلف بدن حیوانات از جمله شاخ، بال، پر، جمجمه پرندگان و حشرات مختلف را که روی دیوار قرار گرفته است، مشاهده کرد. دو زیستگاه تالاب و بوستانی و نیز محیط زیست از دیگر قسمت‌های موزه تاریخ طبیعی اردبیل است که تماشای آن برای دوستداران محیط زیست، جالب خواهد بود.
