«کلیسای مریم مقدس» یکی دیگر از عمارات مذهبی و کهن در شهرستان اردبیل است که در اواخر قرن ۱۹ و در سال ۱۸۷۶ میلادی با کمک و پیگیری خانواده «گالوست میرزاییان» و با طرح «خاچاطور شهبازیان معمار» ساخته شده است. روی درب ورودی کلیسا با استفاده از تکه‌های بریده شده نی و به خط ارمنی چنین نوشته شده است که «این درب خانه حقیقی خداست»، که به رسم یادبود از طرف اگالوس ملیک میرزا یانس به کلیسای مریم مقدس هدیه می‌شود. امروزه از این کلیسا برای انجام فرایض دینی ارامنه و برگزاری مراسم مذهبی استفاده نمی‌شود و آخرین نماز جماعت و مراسم مذهبی در سال ۱۳۲۳ شمسی در این مکان برگزار شده است. در محوطه کلیسا، تعدادی قبر سنگی و رسوبی قرار دارد که حکاکی‌هایی به شکل صلیب روی آن‌ها انجام شده است.
